返流性食管炎的病理表现为急性、亚急性或慢性的炎症。病变程度常不相同，在同一平面上的不同部位取活检，其病变程度也迥异。病变与症状的严重程度很少有平行关系，多发于食管下段，中1/3食管则不常见，肉眼可见食管黏膜充血、水肿、脆而易出血。急性食管炎时黏膜上皮坏死脱落，形成糜烂和浅表溃疡，严重者整个上皮层均可脱落，一般不超过黏膜肌层，慢性食管为时黏膜糜烂后发生纤维化，并可越过黏膜肌层及黏膜下层均见弥漫浸润的淋巴细胞、浆细胞，有时有中性粒细胞。随着病变的进展，食管黏膜糜烂、溃疡和纤维化的反复形成，则可发生食管瘢痕性狭窄。