在作胃、十二指肠镜和结肠镜时，发现食管、胃、十二脂肠、结肠的某个部位有异常改变就需要用活检钳从胃镜或肠镜的活检钳孔插入，针对异常病变的部位钳取活组织病理检查，临床称为粘膜活检。
　　凡有以下异常情况者均须作活检。粘膜粗糙、色泽改变、局部分泌物增多而又不易用水冲去、正常粘膜纹消失、蠕动减弱或消失、组织僵硬、组织脆、接触易出血、糜烂、溃疡、息肉、结节、肿块、丘疹样降起、不规律隆起、菜花样改变等。总之，与正常粘膜表现不一样的都须作活组织检查确定是否有炎症、良性肿瘤还是恶性肿瘤，便于定性诊断、及早进行恰当治疗或手术。所以粘膜活检是相当价值的。